More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3457 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  100 
 
 		 268 aa  536  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  67.16 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  68.11 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.69 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.69 
 
 		 274 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.78 
 
 		 258 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  63.6 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  59.69 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.81 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  60 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  60 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.62 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.61 
 
 		 264 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.62 
 
 		 284 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  58.53 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.22 
 
 		 262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.4 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  58.62 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.77 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.87 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.65 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  58.04 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.38 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.38 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.07 
 
 		 284 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.04 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.82 
 
 		 270 aa  292  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  54.3 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.75 
 
 		 286 aa  291  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  58.27 
 
 		 276 aa  291  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  57.98 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  54.69 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.43 
 
 		 282 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.85 
 
 		 279 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  51.94 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.98 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.08 
 
 		 282 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.18 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  56.57 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  51.57 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  55.78 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 		 255 aa  271  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.67 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  53.12 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.81 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.28 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  50.98 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  49.8 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.56 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.97 
 
 		 256 aa  266  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  49.8 
 
 		 273 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.99 
 
 		 253 aa  265  8e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.56 
 
 		 433 aa  264  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.81 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50.59 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.56 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 		 437 aa  262  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 346 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.57 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  48.61 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.52 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  49.22 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.21 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.82 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  51.55 
 
 		 345 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.2 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.82 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.76 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.82 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  48.64 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.76 
 
 		 358 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  48.64 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  48.64 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.81 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.22 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  46.46 
 
 		 262 aa  255  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 263 aa  254  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.81 
 
 		 253 aa  254  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  48.41 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.39 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.85 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  50.39 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.63 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 462 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.42 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.64 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  47.84 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.27 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>