More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2874 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  80.85 
 
 		 94 aa  152  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 94 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 94 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  70.97 
 
 		 96 aa  136  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  70.97 
 
 		 94 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  70.97 
 
 		 94 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  69.89 
 
 		 94 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  67.74 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 95 aa  130  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  67.74 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  65.59 
 
 		 98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  67.74 
 
 		 94 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 98 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  66.3 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  62.77 
 
 		 103 aa  120  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  62.64 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  64.13 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 100 aa  116  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 98 aa  116  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 102 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  59.57 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  58.06 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  58.06 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  55.91 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  55.91 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  55.91 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  58.7 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 96 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>