More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2574 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
352 aa  728    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  51.93 
 
 
294 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  39.95 
 
 
390 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  47.59 
 
 
443 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  52.82 
 
 
348 aa  265  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  45.36 
 
 
292 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  45.36 
 
 
291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  50.6 
 
 
320 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  48.97 
 
 
300 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  50.6 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  42.41 
 
 
284 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 
283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  43.36 
 
 
406 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  41.85 
 
 
421 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  43.56 
 
 
461 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  45.02 
 
 
286 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  43.18 
 
 
461 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
451 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  43.18 
 
 
461 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  42.8 
 
 
461 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  42.8 
 
 
461 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  45.49 
 
 
281 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  39.93 
 
 
454 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
451 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  39.2 
 
 
453 aa  190  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  39.68 
 
 
502 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 
295 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 
386 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  39.2 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  39.2 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  37.9 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 
300 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  38.96 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  38.96 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  38.96 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  36.24 
 
 
300 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  36.33 
 
 
336 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  38.96 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  38.58 
 
 
291 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  35.22 
 
 
257 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
479 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.89 
 
 
761 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.47 
 
 
808 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.36 
 
 
789 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.25 
 
 
791 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
477 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.11 
 
 
773 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  32.01 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.7 
 
 
773 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.25 
 
 
868 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.27 
 
 
780 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.46 
 
 
750 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
818 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.78 
 
 
783 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.23 
 
 
814 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 
773 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 
654 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.82 
 
 
786 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 
773 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  33.94 
 
 
773 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.81 
 
 
778 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.97 
 
 
809 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 
772 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.94 
 
 
772 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.38 
 
 
752 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.2 
 
 
770 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  32.95 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.96 
 
 
798 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.78 
 
 
682 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.21 
 
 
773 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.85 
 
 
773 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.91 
 
 
795 aa  133  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.42 
 
 
778 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.58 
 
 
840 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  31.52 
 
 
795 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  31.12 
 
 
872 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.13 
 
 
796 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.58 
 
 
775 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.17 
 
 
757 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2593  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.62 
 
 
767 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
794 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1270  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.02 
 
 
767 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.791158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2686  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.62 
 
 
767 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.08 
 
 
840 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  31.25 
 
 
423 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.17 
 
 
837 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.08 
 
 
839 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  34.13 
 
 
808 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.73 
 
 
859 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  40.76 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  31.62 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.2 
 
 
745 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.48 
 
 
679 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  33.33 
 
 
798 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.97 
 
 
771 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.74 
 
 
785 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>