47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2010 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  302  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  59.49 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  50.35 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  50.32 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  46.53 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  50.66 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  42.21 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  39.47 
 
 
162 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  35.71 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  37.93 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  33.57 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  40.69 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  35.48 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  35.33 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  32.41 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  36.96 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  31.88 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  37.24 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  37.5 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1547  hypothetical protein  38.73 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0619985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  37.04 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3260  hypothetical protein  37.78 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.897225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  33.33 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2127  hypothetical protein  37.04 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.87001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2058  hypothetical protein  36.3 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1912  hypothetical protein  36.3 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1874  hypothetical protein  36.3 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00711757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2091  hypothetical protein  36.3 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1865  hypothetical protein  36.3 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2159  hypothetical protein  36.3 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00020937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11270  hypothetical protein  38.2 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0350705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  34.62 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  34.62 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  34.62 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  32.41 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1909  hypothetical protein  34.81 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  39.31 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  35.57 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  36.26 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  38.95 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  30.82 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5072  protein of unknown function DUF456  29.33 
 
 
180 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4254  hypothetical protein  35.61 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2619  protein of unknown function DUF456  29.01 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.145913  normal  0.479134 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  32.28 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>