16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2619 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2619  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
161 aa  297  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.145913  normal  0.479134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  43.61 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0700  protein of unknown function DUF456  50 
 
 
161 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2535  protein of unknown function DUF456  45.64 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1932  protein of unknown function DUF456  34.75 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0633632  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  29.37 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  34.68 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  29.29 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  28.93 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  31.08 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  32.64 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  29.05 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  28.89 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  32.26 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  32.54 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>