More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1816 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  57.77 
 
 		 551 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  63.72 
 
 		 560 aa  761    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  68.77 
 
 		 554 aa  800    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  76.17 
 
 		 554 aa  888    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  56.81 
 
 		 555 aa  690    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  66.06 
 
 		 555 aa  771    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  55.27 
 
 		 558 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  56.6 
 
 		 555 aa  650    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  66.61 
 
 		 553 aa  780    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1133    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  58.94 
 
 		 555 aa  699    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  59.12 
 
 		 555 aa  700    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  62.09 
 
 		 553 aa  741    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  58.83 
 
 		 566 aa  692    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  56.7 
 
 		 618 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  61.76 
 
 		 554 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  61.05 
 
 		 555 aa  720    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  67.09 
 
 		 554 aa  793    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  50.45 
 
 		 560 aa  628  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.43 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  53.8 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.91 
 
 		 557 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  53.62 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  53.62 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  52.73 
 
 		 557 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  53.62 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  52.73 
 
 		 557 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  53.62 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  53.62 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  53.8 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.36 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  53.62 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.73 
 
 		 557 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  53.62 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  52.36 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  53.08 
 
 		 556 aa  618  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  53.92 
 
 		 583 aa  618  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  53.35 
 
 		 558 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  52.36 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  52.36 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  52.36 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  52.36 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  52.36 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  52.36 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  52.17 
 
 		 557 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  52.55 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  51.99 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  52.36 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  51.64 
 
 		 557 aa  611  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  52.36 
 
 		 555 aa  611  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  52.17 
 
 		 555 aa  609  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  52.62 
 
 		 558 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  50.81 
 
 		 558 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  51.46 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  50.45 
 
 		 558 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  51.89 
 
 		 551 aa  588  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  51.71 
 
 		 551 aa  587  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  51.71 
 
 		 551 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.73 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  49.55 
 
 		 565 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  49.55 
 
 		 565 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  50.84 
 
 		 533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 548 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  50.64 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  51.18 
 
 		 553 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  47.99 
 
 		 593 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  50.37 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  49.11 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  50.72 
 
 		 561 aa  551  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  49 
 
 		 552 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  48.92 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  48.9 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  46.99 
 
 		 569 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 		 561 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  48.4 
 
 		 561 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.29 
 
 		 560 aa  538  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.01 
 
 		 559 aa  532  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  47.47 
 
 		 560 aa  535  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.57 
 
 		 561 aa  528  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  45.93 
 
 		 556 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  47.81 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  48.27 
 
 		 564 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  47.47 
 
 		 559 aa  520  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  45.55 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  45.72 
 
 		 573 aa  518  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  46.21 
 
 		 618 aa  511  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  46.79 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  45.01 
 
 		 677 aa  505  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  43.22 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  45.27 
 
 		 561 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 		 588 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 		 588 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  45.36 
 
 		 561 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.53 
 
 		 561 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  45.67 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  45.36 
 
 		 602 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  44.69 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>