66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1611 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  4.77853e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  41.5 
 
 
208 aa  181  8e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.78714e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  37.17 
 
 
201 aa  148  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  34.39 
 
 
197 aa  146  2e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.19009e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  34.2 
 
 
199 aa  146  2e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.10329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  34.52 
 
 
198 aa  141  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  33.98 
 
 
201 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  29.95 
 
 
202 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  5.76193e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  29.47 
 
 
204 aa  84  1e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  26.8 
 
 
409 aa  79.7  2e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  27.14 
 
 
402 aa  77.4  1e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  26.37 
 
 
409 aa  71.6  6e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  25.49 
 
 
454 aa  71.2  1e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1933  hypothetical protein  28 
 
 
374 aa  69.7  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1899  hypothetical protein  28 
 
 
374 aa  69.7  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.126489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  26.13 
 
 
420 aa  68.6  7e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1382  hypothetical protein  38.14 
 
 
376 aa  68.2  9e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000601426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5881  hypothetical protein  23.12 
 
 
186 aa  67  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  23.71 
 
 
403 aa  67  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1432  protein of unknown function DUF445  30.61 
 
 
377 aa  63.2  3e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2530  hypothetical protein  27.96 
 
 
499 aa  62  6e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0952  hypothetical protein  26.42 
 
 
381 aa  61.2  9e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15951e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4423  hypothetical protein  26.42 
 
 
378 aa  61.2  1e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000169589  normal  0.358776 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  24.45 
 
 
461 aa  60.1  2e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4319  hypothetical protein  27.63 
 
 
411 aa  59.7  3e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0741312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0766  hypothetical protein  31.48 
 
 
378 aa  59.3  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.640057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1042  hypothetical protein  25.16 
 
 
378 aa  59.3  3e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.15662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0767  hypothetical protein  25.16 
 
 
381 aa  59.3  4e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.07523e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0954  hypothetical protein  25.16 
 
 
378 aa  58.9  5e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0760  hypothetical protein  25.16 
 
 
381 aa  58.5  5e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.76584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0819  hypothetical protein  25.16 
 
 
381 aa  58.5  6e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.48113e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2844  hypothetical protein  26.4 
 
 
499 aa  58.5  6e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0915  hypothetical protein  33.33 
 
 
381 aa  57.8  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.46533e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0694  hypothetical protein  40.85 
 
 
378 aa  57.4  1e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0408  protein of unknown function DUF445  25.5 
 
 
417 aa  57.4  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0398  protein of unknown function DUF445  25.5 
 
 
417 aa  57.4  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  23.04 
 
 
355 aa  57  2e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  21.4 
 
 
551 aa  56.6  2e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  23.08 
 
 
467 aa  56.6  3e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1098  hypothetical protein  21.78 
 
 
412 aa  55.8  4e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288436  normal  0.0465227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0748  protein of unknown function DUF445  23.76 
 
 
413 aa  55.5  5e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  35.71 
 
 
532 aa  55.5  5e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3973  hypothetical protein  24.16 
 
 
408 aa  55.5  5e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0862  hypothetical protein  26 
 
 
372 aa  55.8  5e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.16192e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  39.47 
 
 
512 aa  55.1  7e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.51164e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1421  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  54.3  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4067  protein of unknown function DUF445  25.87 
 
 
406 aa  52.4  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  32.35 
 
 
364 aa  51.6  7e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0899  hypothetical protein  37.68 
 
 
537 aa  51.6  8e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.860186  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  22.01 
 
 
443 aa  50.8  1e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  22.4 
 
 
392 aa  50.8  1e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  24.4 
 
 
234 aa  48.5  7e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  25.71 
 
 
246 aa  48.1  8e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1026  hypothetical protein  31.88 
 
 
1271 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.37819e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  20.09 
 
 
444 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0033  hypothetical protein  36.07 
 
 
370 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.374714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  24.4 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  23.44 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  24.76 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  17.54 
 
 
444 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  24.76 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  23.44 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  24.76 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  23.92 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  20.79 
 
 
427 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>