89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2851 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  919    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  40.09 
 
 
449 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  35.81 
 
 
458 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  36.2 
 
 
424 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  37.02 
 
 
427 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  36.2 
 
 
424 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  33.86 
 
 
433 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  34.69 
 
 
423 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  35.04 
 
 
449 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  36.88 
 
 
412 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  35.2 
 
 
447 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  35.29 
 
 
442 aa  256  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  35.27 
 
 
449 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  35.62 
 
 
450 aa  256  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  34.82 
 
 
449 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  35.14 
 
 
448 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  33.94 
 
 
442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  34.73 
 
 
442 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  35.76 
 
 
430 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  33.56 
 
 
450 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  33.93 
 
 
424 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  34.17 
 
 
436 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  32.96 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  32.8 
 
 
422 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  31.39 
 
 
424 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  33.03 
 
 
424 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  31.83 
 
 
435 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  33.94 
 
 
454 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  31.04 
 
 
437 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  31.06 
 
 
443 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  32.06 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  31.44 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  27.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  30.4 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  26.46 
 
 
415 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  28.83 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  28.41 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  25.78 
 
 
415 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  25.11 
 
 
415 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  27.84 
 
 
417 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  25.34 
 
 
415 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  25.11 
 
 
415 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  25.11 
 
 
415 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  24.89 
 
 
415 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  25.36 
 
 
411 aa  124  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  24.72 
 
 
410 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  25.11 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  25.11 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  24.89 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  25.9 
 
 
415 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  25.06 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  24.13 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  25.83 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  25.39 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  25.17 
 
 
413 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  27.19 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  25.68 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  25.12 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  24.88 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  28.44 
 
 
429 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  26.23 
 
 
413 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  25.67 
 
 
407 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  25.34 
 
 
411 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  25.95 
 
 
410 aa  107  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  27.49 
 
 
425 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  26.86 
 
 
419 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  24.12 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  23.36 
 
 
418 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  24.59 
 
 
412 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  22.9 
 
 
418 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  24.48 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  25.17 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  24.59 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  24.32 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  25.23 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  26.17 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  24.37 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  22.54 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  24.59 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  28.37 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  24.65 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  22.72 
 
 
411 aa  77  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  26.09 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  26.57 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3152  hypothetical protein  24.55 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2730  hypothetical protein  22.75 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00608426  hitchhiker  0.000203528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  22.3 
 
 
374 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  25.3 
 
 
399 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3515  hypothetical protein  27.17 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>