64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3152 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3152  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  803    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  29.54 
 
 
426 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  29.25 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  27.93 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  29 
 
 
437 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  21.62 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  29.65 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  26.76 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  27.41 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  25.48 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  32.59 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  27.08 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  30.77 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  29.06 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  25.86 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  23.89 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  25.71 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  26.43 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  26.14 
 
 
435 aa  63.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  30.34 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  27.76 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  22.66 
 
 
450 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  23.74 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  24.55 
 
 
445 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  24.06 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  24.2 
 
 
415 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  22.78 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  28.31 
 
 
424 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  29.91 
 
 
449 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  24.77 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  23.29 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  23.6 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  23.74 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  24.03 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  23.45 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  27.93 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  30 
 
 
447 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  20.23 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  26.69 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  22.25 
 
 
427 aa  57  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  27.15 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  23.36 
 
 
424 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  22.83 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  27.27 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  22.83 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  25.47 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  27.27 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  23.28 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  22.37 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  22.37 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  23.81 
 
 
410 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  24.41 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  23.89 
 
 
442 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  23.45 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  24.66 
 
 
442 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  27.83 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  25.96 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  25.48 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  29.17 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  23.58 
 
 
449 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  25.97 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  21.93 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  21.5 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  21 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>