76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3515 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  92.98 
 
 		 399 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3515  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  790    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5444  hypothetical protein  61.15 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  29.34 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  28.34 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  25.25 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  25.76 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  31.73 
 
 		 413 aa  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  30.92 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  30.72 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  31.33 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  31.48 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  30.69 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  31.14 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  30.49 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  25.38 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  27.69 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  29.87 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  30.36 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  29.09 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  25.08 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  29.45 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  25.66 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  29.93 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  24.76 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  28.04 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  29.04 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  30.45 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  28.63 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  29.04 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  28.05 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  29.04 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  33.69 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  29.04 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  27.61 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  29.93 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  30.25 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  28.62 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  29.27 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  31.61 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  34.05 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  33.05 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  30.03 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  27.38 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  23.26 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  26.54 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  23.67 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  23.88 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  27.92 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  22.67 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  22.54 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  24.5 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  22.67 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  23.75 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  24.01 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  26.46 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  24.74 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  24.69 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  27.41 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  25.66 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  22.61 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  29.95 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  24.51 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  24.81 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  23.32 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  23.17 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  27.05 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  24.45 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  24.01 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  24.77 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  30.21 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  34.09 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  25.16 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>