40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2730 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2730  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  803    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00608426  hitchhiker  0.000203528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3196  hypothetical protein  44.49 
 
 
453 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1193  hypothetical protein  43.72 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  27.43 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  22.75 
 
 
445 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  26.88 
 
 
442 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  25.77 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  25.68 
 
 
442 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  26.89 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  23.79 
 
 
458 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  28.87 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  24.02 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  23.29 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  23.24 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  23.68 
 
 
422 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  24.01 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  21.66 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  24.76 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  23.62 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  23.68 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  20.59 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  21.35 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  24.31 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  25.48 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  23.23 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  24.27 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  24.27 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  24.27 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  23.7 
 
 
415 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  21.23 
 
 
449 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  24.27 
 
 
415 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  23.68 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  24.6 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  20.87 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  21.9 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  24.69 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  24.37 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  27.78 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  22.89 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  27.59 
 
 
416 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>