211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2647 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  77.08 
 
 		 192 aa  310  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  78.19 
 
 		 190 aa  307  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  74.87 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  75.92 
 
 		 191 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  78.19 
 
 		 192 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  74.87 
 
 		 191 aa  301  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  73.4 
 
 		 190 aa  294  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  73.94 
 
 		 190 aa  290  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  69.63 
 
 		 191 aa  290  9e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  69.11 
 
 		 191 aa  288  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  66.49 
 
 		 191 aa  276  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  67.02 
 
 		 191 aa  274  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  69.63 
 
 		 191 aa  274  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  66.15 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  64.92 
 
 		 191 aa  265  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  65.97 
 
 		 191 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  64.89 
 
 		 190 aa  260  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  61.7 
 
 		 192 aa  245  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  60.75 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  59.69 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  59.57 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  60.11 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  57.89 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  62.3 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  57.58 
 
 		 197 aa  228  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  55.38 
 
 		 195 aa  224  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  57.44 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  54.36 
 
 		 195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  57.59 
 
 		 191 aa  221  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  58.51 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  53.4 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  54.79 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  54.35 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  54.35 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  57.98 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  55.5 
 
 		 178 aa  207  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  55.38 
 
 		 178 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  54.97 
 
 		 178 aa  207  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  52.91 
 
 		 179 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  51.83 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  53.4 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  52.88 
 
 		 178 aa  201  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  51.6 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  51.02 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  47.94 
 
 		 194 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  50.53 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  50 
 
 		 194 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  49.2 
 
 		 696 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  50.28 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  47.89 
 
 		 696 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  47.92 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  47.37 
 
 		 221 aa  175  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  48.39 
 
 		 392 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  44.39 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  43.39 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  48.13 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  47.31 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  41.45 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  41.05 
 
 		 178 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  41.05 
 
 		 178 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  42.19 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  38.1 
 
 		 216 aa  130  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  39.18 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  39.18 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  40.21 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  39.18 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  38.42 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  49.28 
 
 		 140 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  44.85 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  45.86 
 
 		 139 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  45.59 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  45.93 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  45.26 
 
 		 140 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  43.8 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  43.8 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  43.8 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  44.12 
 
 		 146 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  43.38 
 
 		 140 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  44.85 
 
 		 140 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  44.03 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  43.66 
 
 		 139 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  43.36 
 
 		 139 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  43.66 
 
 		 139 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  43.66 
 
 		 139 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  44.12 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.65 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  43.07 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.65 
 
 		 140 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  43.61 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  42.86 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>