48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2120 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  100 
 
 
93 aa  187  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  64.52 
 
 
93 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  52.69 
 
 
93 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  52.69 
 
 
97 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1467  hypothetical protein  55.17 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  47.17 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  41.38 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  41.38 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  41.38 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  37.7 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  32.18 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  37.7 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  30.95 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  39.66 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  40.68 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  32.47 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  26.67 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  32.47 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  36.07 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  29.87 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  26.67 
 
 
96 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0921  prevent-host-death family protein  27.38 
 
 
89 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.387734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  37.1 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  31.88 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  25.88 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  31.94 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  28.21 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  31.15 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  28.89 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2906  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3716  prevent-host-death family protein  29.07 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  32.88 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  26.74 
 
 
87 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  32.39 
 
 
91 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  31.17 
 
 
86 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  30.68 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  31.75 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  26.74 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  27.4 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  32.73 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  31.34 
 
 
90 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  28.09 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  28.12 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
84 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>