More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2038 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
166 aa  333  9e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.42 
 
 
168 aa  200  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.13 
 
 
163 aa  192  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.49 
 
 
163 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.24 
 
 
163 aa  191  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.05 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.05 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  57.69 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  57.69 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.52 
 
 
172 aa  187  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.06 
 
 
163 aa  187  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.37 
 
 
161 aa  186  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.42 
 
 
162 aa  183  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.77 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.42 
 
 
162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  54.84 
 
 
164 aa  180  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.13 
 
 
163 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  52.53 
 
 
166 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.13 
 
 
162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.21 
 
 
170 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.12 
 
 
167 aa  177  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.49 
 
 
165 aa  177  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  53.25 
 
 
159 aa  176  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.19 
 
 
163 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 
161 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  54.84 
 
 
167 aa  175  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
167 aa  175  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  55.48 
 
 
170 aa  174  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 
174 aa  174  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.25 
 
 
168 aa  174  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
168 aa  173  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  54.19 
 
 
169 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  50.62 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.88 
 
 
174 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  50.97 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.94 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  53.5 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.85 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  56.13 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  52.26 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  50.97 
 
 
163 aa  171  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  51.28 
 
 
164 aa  170  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  55.97 
 
 
167 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
165 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.9 
 
 
163 aa  169  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.13 
 
 
167 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.13 
 
 
167 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.84 
 
 
161 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  52.9 
 
 
166 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.97 
 
 
163 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.28 
 
 
169 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.28 
 
 
169 aa  168  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  53.21 
 
 
162 aa  168  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  54.84 
 
 
167 aa  168  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  50.96 
 
 
172 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  50.96 
 
 
172 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
187 aa  168  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.64 
 
 
169 aa  167  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.64 
 
 
169 aa  167  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.13 
 
 
176 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
172 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  49.69 
 
 
163 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  167  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  49.69 
 
 
161 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
163 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.49 
 
 
164 aa  166  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  51.61 
 
 
165 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  54.19 
 
 
161 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  51.61 
 
 
156 aa  166  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  50.31 
 
 
185 aa  165  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.26 
 
 
163 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
163 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.97 
 
 
163 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1320  acetolactate synthase, small subunit  51.61 
 
 
163 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  51.92 
 
 
164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4787  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.03 
 
 
163 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0258419  hitchhiker  0.00663707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42510  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 
163 aa  164  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
175 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.39 
 
 
163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.97 
 
 
163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>