27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1283 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
203 aa  144  7e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74673e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
201 aa  141  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  40.45 
 
 
202 aa  134  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  42.78 
 
 
212 aa  133  1e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  40.33 
 
 
204 aa  126  2e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  36.42 
 
 
198 aa  116  2e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  35.84 
 
 
191 aa  117  2e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  33.51 
 
 
205 aa  87.8  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  32.5 
 
 
170 aa  68.2  7e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
167 aa  68.2  8e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
125 aa  59.7  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
124 aa  58.9  4e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
106 aa  57.8  9e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
105 aa  57  1e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  35.64 
 
 
126 aa  55.1  7e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
123 aa  53.1  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  31.63 
 
 
119 aa  53.5  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  38.03 
 
 
134 aa  52.8  3e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 
119 aa  51.6  7e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  30.83 
 
 
622 aa  48.9  5e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  22.11 
 
 
220 aa  48.5  6e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
622 aa  48.1  7e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.67 
 
 
691 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  40 
 
 
169 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>