23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1291 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  100 
 
 		 170 aa  329  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  94.48 
 
 		 167 aa  293  8e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1706  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0763417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  46.25 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  46.25 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  31.4 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  28.33 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  32 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  29.89 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  36 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  38.75 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 105 aa  52.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  29.81 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 124 aa  47.4  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  27.47 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>