26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2316 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
125 aa  259  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
124 aa  121  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
105 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  54.9 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  49.49 
 
 
134 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
106 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  50.48 
 
 
123 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  41.24 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  39.36 
 
 
691 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  34 
 
 
212 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  36.73 
 
 
690 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  36.36 
 
 
202 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  37.21 
 
 
198 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  37.21 
 
 
191 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
204 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  36.84 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  39.51 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
176 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>