296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0071 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
159 aa  317  4e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.13 
 
 
160 aa  152  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  49.39 
 
 
168 aa  142  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.13 
 
 
158 aa  116  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.4 
 
 
156 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  39.49 
 
 
157 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  33.53 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  34.68 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.21 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  35.45 
 
 
197 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  34.1 
 
 
190 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.97 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.13 
 
 
209 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.15 
 
 
203 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.81 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  7.86086e-08 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  37.14 
 
 
197 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  37.86 
 
 
197 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.6 
 
 
220 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  38.57 
 
 
200 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  30.73 
 
 
198 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  34.57 
 
 
200 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  36.43 
 
 
201 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  37.86 
 
 
202 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  35.26 
 
 
200 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  35 
 
 
212 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.46 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  32.31 
 
 
199 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  34.19 
 
 
687 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.62 
 
 
199 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  37.59 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.88 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  36.88 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.88 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  36.88 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.77757e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.85 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.59 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.88 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  34.97 
 
 
199 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1270  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  36.42 
 
 
174 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  32.77 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  34.48 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  32.77 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
202 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  32.77 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  32.77 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  31.09 
 
 
218 aa  84.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  31.63 
 
 
200 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  30.05 
 
 
197 aa  83.6  1e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  33.85 
 
 
200 aa  82.8  2e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  32.82 
 
 
199 aa  82.4  2e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.05 
 
 
198 aa  82.4  3e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  33.55 
 
 
200 aa  81.6  3e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  35.46 
 
 
197 aa  82  3e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  34.36 
 
 
201 aa  81.6  4e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.9905e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  31.12 
 
 
200 aa  81.6  4e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  31.77 
 
 
197 aa  81.3  5e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  31.77 
 
 
197 aa  81.3  5e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  32.26 
 
 
199 aa  81.3  5e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  33.1 
 
 
207 aa  81.3  6e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  31.12 
 
 
200 aa  80.9  7e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  30.61 
 
 
200 aa  80.9  7e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  30.21 
 
 
199 aa  80.9  7e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.61 
 
 
200 aa  80.9  7e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  32.26 
 
 
199 aa  80.9  7e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  30.61 
 
 
200 aa  80.5  8e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  30.21 
 
 
199 aa  80.5  8e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0566  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.15 
 
 
172 aa  80.1  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  34.04 
 
 
205 aa  79.7  2e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.02 
 
 
198 aa  79  2e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  32.18 
 
 
203 aa  79.3  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.72355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  35.29 
 
 
199 aa  79  3e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  42.86 
 
 
193 aa  79  3e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  6.43052e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  30.61 
 
 
200 aa  79  3e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  37.93 
 
 
201 aa  78.6  3e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.68 
 
 
203 aa  78.2  5e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  31.12 
 
 
200 aa  78.2  5e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.33 
 
 
172 aa  77.8  5e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  34.64 
 
 
199 aa  77.4  8e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  34.64 
 
 
199 aa  77.4  8e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40.6 
 
 
193 aa  77  8e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  31.96 
 
 
205 aa  76.6  1e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  33.33 
 
 
198 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
193 aa  76.3  1e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 
203 aa  77  1e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.47 
 
 
201 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.5 
 
 
204 aa  75.5  2e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  31.43 
 
 
201 aa  76.3  2e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68945e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  31.43 
 
 
201 aa  76.3  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  33.77 
 
 
199 aa  75.9  2e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  28.5 
 
 
204 aa  75.9  2e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.61 
 
 
209 aa  75.5  3e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  32.86 
 
 
201 aa  75.5  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  34.01 
 
 
199 aa  75.5  3e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
188 aa  75.5  3e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  29.68 
 
 
202 aa  75.5  3e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  31.61 
 
 
198 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.86 
 
 
201 aa  75.5  3e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  30.28 
 
 
206 aa  75.5  3e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  30.97 
 
 
201 aa  75.5  3e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>