More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3675 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  100 
 
 
125 aa  251  2e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  53.72 
 
 
131 aa  137  4e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.45103e-05  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  50 
 
 
120 aa  136  8e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  54.87 
 
 
119 aa  132  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  52.68 
 
 
122 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  54.05 
 
 
127 aa  130  8e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  56.07 
 
 
126 aa  129  2e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.26248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  50.42 
 
 
121 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  50.43 
 
 
118 aa  125  1e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  50.43 
 
 
118 aa  125  1e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  50.43 
 
 
118 aa  125  1e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  47.37 
 
 
119 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  49.57 
 
 
118 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.32995e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  49.57 
 
 
118 aa  123  8e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  49.57 
 
 
118 aa  123  8e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  49.57 
 
 
118 aa  123  8e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  48.72 
 
 
118 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  49.57 
 
 
118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  48.72 
 
 
118 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  54.63 
 
 
119 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  49.57 
 
 
118 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.6841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  50.43 
 
 
122 aa  119  1e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.70949e-12  hitchhiker  1.54001e-07 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  44.95 
 
 
116 aa  117  4e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  52.78 
 
 
117 aa  117  5e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 
118 aa  116  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  45.76 
 
 
118 aa  116  1e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  52.38 
 
 
123 aa  114  4e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 
130 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 
116 aa  113  8e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  48.08 
 
 
129 aa  112  2e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  45.69 
 
 
118 aa  112  2e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  42.97 
 
 
128 aa  112  2e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 
122 aa  112  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 
122 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 
119 aa  109  1e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.52845e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  48.6 
 
 
121 aa  108  2e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  44.63 
 
 
123 aa  108  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  40.52 
 
 
122 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  46.09 
 
 
116 aa  107  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  46.09 
 
 
116 aa  107  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  41.32 
 
 
141 aa  107  7e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  45.28 
 
 
131 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  38.58 
 
 
138 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  44.54 
 
 
137 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  42.11 
 
 
121 aa  103  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 
138 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  43.81 
 
 
119 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 
133 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  43.81 
 
 
119 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  42.31 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  41.54 
 
 
132 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 
132 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 
124 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  43.55 
 
 
136 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  41.9 
 
 
147 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  42.4 
 
 
133 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  40.87 
 
 
127 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  40.77 
 
 
133 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 
132 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  45.19 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 
132 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  39.06 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  39.68 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  43.1 
 
 
134 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  39.53 
 
 
129 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  40 
 
 
159 aa  97.1  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  40.5 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  41.44 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.64371e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  42.45 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  41.18 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  40 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  42.11 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  45.95 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  41.46 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0265365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 
156 aa  94.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 
127 aa  94  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  37.12 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 
139 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  45.05 
 
 
138 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  40 
 
 
139 aa  93.6  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>