More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1020 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
315 aa  631  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4605  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.67 
 
 
315 aa  421  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0573  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.55 
 
 
312 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.18897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0312  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  50.81 
 
 
297 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1933  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  48.24 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0148505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1497  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  48.24 
 
 
312 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2415  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  47.92 
 
 
312 aa  285  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1944  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  47.92 
 
 
312 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.436869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01667  predicted electron transfer flavoprotein, FAD-binding  47.92 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01656  hypothetical protein  47.92 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1915  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  47.6 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3231  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.28 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7218  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1901  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  46.96 
 
 
312 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1396  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  45.74 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0992416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4040  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.59 
 
 
313 aa  272  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1483  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  46.65 
 
 
311 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.327265  normal  0.060964 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1991  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  46.65 
 
 
311 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.0177014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1819  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  46.33 
 
 
311 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1465  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  46.96 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.486189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2678  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.73 
 
 
313 aa  265  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1449  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  46.65 
 
 
311 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  0.334512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  41.1 
 
 
313 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  41.23 
 
 
313 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  40.91 
 
 
313 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  40.91 
 
 
313 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.91 
 
 
313 aa  245  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  40.91 
 
 
313 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  40.91 
 
 
313 aa  245  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  40.58 
 
 
313 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  39.94 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0083  putative electron transfer flavoprotein FixB  39.94 
 
 
313 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0086  putative electron transfer flavoprotein FixB  39.61 
 
 
313 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.424213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  39.61 
 
 
313 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0085  putative electron transfer flavoprotein FixB  39.61 
 
 
313 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.57 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.207117  normal  0.343811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0266  hypothetical protein  38.36 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1842  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.64 
 
 
296 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2872  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.13 
 
 
305 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.33 
 
 
319 aa  205  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08780  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.19 
 
 
295 aa  202  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.821197 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3105  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.43 
 
 
294 aa  201  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291698 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.44 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02680  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.81 
 
 
302 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.867701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2007  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.3 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.175857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  36.64 
 
 
360 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.08 
 
 
326 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  36.23 
 
 
341 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.69 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2121  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.73 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.17 
 
 
610 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.93 
 
 
296 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
325 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.32 
 
 
316 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.14 
 
 
338 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.72 
 
 
410 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.28 
 
 
329 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.4 
 
 
601 aa  155  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.78 
 
 
442 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.64 
 
 
329 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.22 
 
 
345 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.61 
 
 
443 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.78 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0332  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.35 
 
 
287 aa  152  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.91 
 
 
439 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.34 
 
 
374 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.33 
 
 
346 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.61 
 
 
442 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.67 
 
 
399 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09240  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.34 
 
 
297 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.263835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.53 
 
 
448 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.82 
 
 
452 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.22 
 
 
335 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.73 
 
 
368 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4277  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.92 
 
 
342 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.11 
 
 
333 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.93 
 
 
452 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.5 
 
 
441 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.62 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.52 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.33 
 
 
441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.11 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.03 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0576  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.68 
 
 
287 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.248124  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  33.43 
 
 
367 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0712  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.54 
 
 
320 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.22 
 
 
589 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.24 
 
 
364 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.24 
 
 
364 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  34.97 
 
 
318 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.46 
 
 
317 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.23 
 
 
368 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.67 
 
 
318 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.12 
 
 
317 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.82 
 
 
447 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.93 
 
 
370 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  32.72 
 
 
335 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  32.72 
 
 
335 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.39 
 
 
321 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.12 
 
 
443 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>