39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1824 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1210    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  52.64 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  47.49 
 
 		 578 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  43.96 
 
 		 580 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  29.83 
 
 		 534 aa  190  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  29.83 
 
 		 534 aa  190  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 		 534 aa  189  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  29.68 
 
 		 534 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  29.68 
 
 		 534 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  29.05 
 
 		 534 aa  187  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  27.86 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  26.33 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  26.85 
 
 		 534 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.49 
 
 		 506 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  25.08 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  24.9 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  24.91 
 
 		 742 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  26.8 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  23.36 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  26.24 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  25.6 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  26.99 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  21.59 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  21.59 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  25.29 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  25.83 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  26.62 
 
 		 624 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  23.98 
 
 		 470 aa  49.7  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  21.56 
 
 		 615 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  23.53 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  23.53 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  23.53 
 
 		 466 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  23.53 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  23.53 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  25.61 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  23.53 
 
 		 466 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3459  flavin-containing monooxygenase  28.09 
 
 		 456 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1751 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>