126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3478 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.77 
 
 		 197 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  60.85 
 
 		 203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  60.32 
 
 		 197 aa  230  9e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  61.5 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  61.08 
 
 		 196 aa  225  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  60.96 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  60.94 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  63.74 
 
 		 190 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  57.89 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.84 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  60.99 
 
 		 190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  57.37 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  57.37 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  59.79 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  59.78 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  59.78 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  59.78 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  59.89 
 
 		 198 aa  214  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  60.89 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  60.99 
 
 		 183 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  58.79 
 
 		 203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  56.63 
 
 		 194 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  59.57 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  58.24 
 
 		 199 aa  208  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  59.36 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  57.69 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  59.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  59.34 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.91 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  59.22 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  57.61 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  58.06 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  62.57 
 
 		 199 aa  199  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.28 
 
 		 187 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  56.45 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.28 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  56.07 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  58.1 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  56.91 
 
 		 189 aa  194  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.35 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.35 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  55.74 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.98 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  56.28 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  59.47 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  55.43 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  55.32 
 
 		 204 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.04 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.28 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.28 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  55.87 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  54.26 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  49.46 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.31 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.45 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.02 
 
 		 196 aa  158  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1100  GPR1/FUN34/yaaH family protein  49.74 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.679326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  48.39 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.36 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.89 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  42.31 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.57 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  40.33 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.33 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.58 
 
 		 223 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.78 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.9 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.49 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0815  GPR1/FUN34/YaaH family protein  38.3 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  41.36 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  40.84 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.57 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.57 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.5 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.2 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.07 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  36.6 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.6 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  36.9 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  36.6 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  36.6 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  36.6 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  36.6 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3251  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.6 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000382822  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  39.34 
 
 		 274 aa  99  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3245  GPR1/FUN34/YaaH family protein  36.08 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  36.08 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>