More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2513 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  53.08 
 
 
131 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  48.84 
 
 
129 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  52.46 
 
 
128 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  49.59 
 
 
136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  47.41 
 
 
158 aa  126  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  42.19 
 
 
134 aa  114  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  42.75 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  42.98 
 
 
131 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  42.4 
 
 
139 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  39.23 
 
 
139 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 
139 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  41.13 
 
 
148 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 
148 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
150 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  41.13 
 
 
150 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  41.46 
 
 
143 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
142 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  37.32 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  39.84 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  40.65 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  40.65 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  40.65 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  40.65 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  40.65 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  39.55 
 
 
154 aa  97.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  40.65 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  40.65 
 
 
142 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  36.92 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  35.88 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 
126 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  42.06 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  37.3 
 
 
166 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.6 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  38.21 
 
 
149 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.4 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 
169 aa  87  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  38.17 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1963  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876725  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  36.89 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0480  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 
164 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0164  ferric uptake regulator, Fur family  34.23 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  37.8 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  33.82 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  35.77 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0847  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  37.06 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  37.06 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  36.88 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  35.86 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  36.88 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  36.88 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  36.88 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2002  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0758566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  37.89 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  29.84 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  34.97 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  34.97 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>