More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2653 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  100 
 
 
210 aa  416  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.31 
 
 
209 aa  194  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  46.07 
 
 
206 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  41.71 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.17 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  36.53 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  31.25 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.95 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
409 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  34.96 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.92 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  28.98 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
415 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
411 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  36 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
278 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.36 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  33.9 
 
 
1014 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.54 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
295 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
267 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
262 aa  62.8  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  36.7 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  36 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
263 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.88 
 
 
251 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.23 
 
 
265 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
270 aa  62  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
278 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
265 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.83 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
237 aa  62  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  32.17 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
274 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.2 
 
 
254 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.14 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.32 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  31.82 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.82 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
276 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.82 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  32.64 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3310  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00554158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.36 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
424 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.19 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.15 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.84 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 
251 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  30.84 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.82 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 
251 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 
251 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
270 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
287 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
1039 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>