More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1498 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  75.33 
 
 		 298 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  75 
 
 		 298 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  76.09 
 
 		 298 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  74.83 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  72.91 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  72.39 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  71.72 
 
 		 307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  64.88 
 
 		 301 aa  391  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  63.33 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  57.67 
 
 		 312 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  57.67 
 
 		 312 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  57 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  58.16 
 
 		 314 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  55.23 
 
 		 319 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  55.45 
 
 		 319 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  54.61 
 
 		 310 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  55.48 
 
 		 312 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  55.78 
 
 		 312 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  55.78 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  54.24 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  54.42 
 
 		 312 aa  341  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  54.08 
 
 		 312 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  54.08 
 
 		 312 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  54.08 
 
 		 312 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  55.59 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  55.59 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  55.59 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  52.54 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  53.74 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  53.74 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  53.74 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  55.25 
 
 		 315 aa  338  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  52.2 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  53.58 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  53.85 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  53.92 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  52.03 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  51.52 
 
 		 315 aa  328  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  52.22 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  49.16 
 
 		 312 aa  318  7e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  50.17 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  53.24 
 
 		 320 aa  316  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  53.24 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  49.66 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  50.51 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  49.66 
 
 		 313 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  49.66 
 
 		 313 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  50.94 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  38.59 
 
 		 324 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  37.58 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  38.85 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  39.06 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  38.61 
 
 		 328 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  35.93 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  38.05 
 
 		 327 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  38.21 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  36.58 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  36 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  35.88 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  36.54 
 
 		 323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  36.54 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  38.87 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 		 339 aa  178  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  35.74 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  37.62 
 
 		 324 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  35.2 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  36.07 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  36.07 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  36.07 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  34.68 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  36.66 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  35.41 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  35.88 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  32.89 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  34.32 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  28.14 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.95 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  30.24 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  28.95 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.39 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  26.85 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  28.45 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  28.81 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  27.21 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.67 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.67 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.67 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  25 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  25.76 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  25.76 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>