More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1081 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
384 aa  786  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  71.39 
 
 
378 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  71.39 
 
 
378 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  74.13 
 
 
373 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  66.08 
 
 
380 aa  506  1e-142  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  67.89 
 
 
379 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  66.93 
 
 
362 aa  493  1e-138  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  57.18 
 
 
379 aa  445  1e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  57.41 
 
 
372 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  57.68 
 
 
349 aa  407  1e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  56.28 
 
 
366 aa  399  1e-110  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  57.3 
 
 
362 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  56.18 
 
 
362 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  57.75 
 
 
357 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  55.49 
 
 
346 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  56.91 
 
 
353 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  54.55 
 
 
346 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  50.54 
 
 
344 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  51.4 
 
 
342 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  51.39 
 
 
327 aa  358  1e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  54.32 
 
 
349 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  51.2 
 
 
341 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  50.99 
 
 
338 aa  336  4e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  72.52 
 
 
382 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  63.24 
 
 
383 aa  269  7e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  39.56 
 
 
349 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  38.02 
 
 
343 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  38.67 
 
 
335 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  38.65 
 
 
326 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  36.29 
 
 
361 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  37.81 
 
 
350 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  39.94 
 
 
355 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  40.72 
 
 
360 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  39.13 
 
 
360 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.39 
 
 
350 aa  223  5e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  38.95 
 
 
353 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  38.15 
 
 
328 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  38.15 
 
 
328 aa  222  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.19 
 
 
347 aa  222  1e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  39.06 
 
 
320 aa  221  2e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  39.63 
 
 
332 aa  219  4e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  37.47 
 
 
329 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.96 
 
 
345 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  38.06 
 
 
323 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  38.8 
 
 
367 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.78 
 
 
320 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  36.51 
 
 
323 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  38.84 
 
 
353 aa  215  1e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  38.63 
 
 
364 aa  214  2e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.67 
 
 
355 aa  212  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  38.46 
 
 
354 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.97 
 
 
323 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  40.16 
 
 
369 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.83 
 
 
374 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  37.73 
 
 
388 aa  210  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  36.53 
 
 
393 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.89 
 
 
324 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 
323 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 
323 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  37.13 
 
 
364 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  37.32 
 
 
336 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  36.34 
 
 
362 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  36.57 
 
 
358 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  48.36 
 
 
493 aa  206  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  48.36 
 
 
457 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.34 
 
 
320 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  36.89 
 
 
365 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 
323 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 
363 aa  202  1e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  46.95 
 
 
460 aa  201  2e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  45.37 
 
 
460 aa  201  2e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  36.73 
 
 
369 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  46.95 
 
 
460 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.83 
 
 
449 aa  199  8e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  46.01 
 
 
449 aa  198  1e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.37 
 
 
449 aa  198  2e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  35.41 
 
 
349 aa  197  2e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  45.54 
 
 
452 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  32.45 
 
 
417 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  32.44 
 
 
408 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 
324 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  32.06 
 
 
388 aa  190  3e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  35.45 
 
 
375 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  39.73 
 
 
362 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  40 
 
 
362 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  33.68 
 
 
339 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  30.43 
 
 
400 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  31.88 
 
 
401 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  39.67 
 
 
352 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  30.83 
 
 
406 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  38.11 
 
 
359 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  31.01 
 
 
399 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  35.66 
 
 
363 aa  185  1e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  38.08 
 
 
353 aa  184  2e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  35.16 
 
 
329 aa  184  2e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.21 
 
 
357 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30.77 
 
 
316 aa  183  5e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.04 
 
 
319 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 
406 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.06 
 
 
337 aa  182  8e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>