More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2664 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
573 aa  1159    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.64 
 
 
558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.46 
 
 
554 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  38.87 
 
 
558 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  38.82 
 
 
558 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  38.69 
 
 
557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  36.27 
 
 
562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  37.99 
 
 
558 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.16 
 
 
558 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  34.76 
 
 
556 aa  362  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.66 
 
 
557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.69 
 
 
561 aa  343  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  34.05 
 
 
561 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.05 
 
 
559 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  36.12 
 
 
564 aa  332  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  33.39 
 
 
560 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.81 
 
 
563 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  33.04 
 
 
560 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  36.09 
 
 
571 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.97 
 
 
555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  34.15 
 
 
571 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.8 
 
 
561 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  36.94 
 
 
544 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  34.38 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  34.19 
 
 
561 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  34.7 
 
 
563 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  35.26 
 
 
561 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  34.27 
 
 
585 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  34.91 
 
 
578 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.03 
 
 
559 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 
552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  31.37 
 
 
565 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.89 
 
 
549 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.94 
 
 
599 aa  307  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  34.59 
 
 
547 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  33.14 
 
 
560 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.32 
 
 
559 aa  299  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.25 
 
 
558 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  34.65 
 
 
582 aa  296  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 
557 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  32.97 
 
 
551 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 
557 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.88 
 
 
549 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  32.3 
 
 
558 aa  294  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.51 
 
 
557 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  31.19 
 
 
547 aa  292  9e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.55 
 
 
556 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  32.95 
 
 
557 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  34.28 
 
 
558 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  33.98 
 
 
549 aa  287  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.95 
 
 
592 aa  286  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  30.89 
 
 
549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  31.61 
 
 
559 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.81 
 
 
568 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  31.28 
 
 
552 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.83 
 
 
561 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  34.44 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.47 
 
 
547 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  30.07 
 
 
582 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.42 
 
 
559 aa  272  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  34.27 
 
 
537 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.31 
 
 
555 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  30.52 
 
 
553 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  29.34 
 
 
547 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  30.72 
 
 
550 aa  269  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  29.69 
 
 
581 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.81 
 
 
530 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  32.84 
 
 
576 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  29.69 
 
 
581 aa  266  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.56 
 
 
547 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
526 aa  266  7e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.15 
 
 
542 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.33 
 
 
525 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.33 
 
 
525 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.91 
 
 
551 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  31.45 
 
 
565 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  31.45 
 
 
565 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  31.71 
 
 
559 aa  264  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.56 
 
 
525 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.74 
 
 
547 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  28.04 
 
 
549 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.44 
 
 
525 aa  260  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  30.44 
 
 
559 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  27.86 
 
 
549 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.12 
 
 
561 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  31.28 
 
 
559 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  31.37 
 
 
562 aa  258  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  33.62 
 
 
562 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  33.62 
 
 
562 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.52 
 
 
584 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  29.79 
 
 
591 aa  257  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.52 
 
 
514 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.59 
 
 
565 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.62 
 
 
559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.09 
 
 
553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.35 
 
 
558 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  29.18 
 
 
559 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  29.58 
 
 
560 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  29.15 
 
 
544 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.08 
 
 
534 aa  253  9.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>