More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1939 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  100 
 
 
444 aa  894    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  55.35 
 
 
452 aa  504  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  51.46 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  53.15 
 
 
449 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  48.65 
 
 
454 aa  429  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  45.77 
 
 
456 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  46.41 
 
 
462 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  40.05 
 
 
446 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  40.64 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
446 aa  332  9e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  40.09 
 
 
441 aa  323  5e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  36.93 
 
 
469 aa  319  7e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  37.3 
 
 
468 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  36.99 
 
 
468 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  36.7 
 
 
469 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35.81 
 
 
465 aa  317  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  36.22 
 
 
468 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  36.4 
 
 
468 aa  315  9e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  36.45 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  37.53 
 
 
463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  35.84 
 
 
469 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  37.53 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  34.87 
 
 
454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  34.47 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  37.3 
 
 
462 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  35.71 
 
 
452 aa  302  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  36.73 
 
 
447 aa  301  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  35.87 
 
 
447 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  34.37 
 
 
463 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  35.86 
 
 
486 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  37.53 
 
 
473 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  33.78 
 
 
460 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  34.47 
 
 
450 aa  293  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  35.35 
 
 
450 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  36.32 
 
 
455 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  33.11 
 
 
460 aa  291  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  32.73 
 
 
449 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  36.63 
 
 
454 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  35.53 
 
 
442 aa  289  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  34 
 
 
460 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  36.47 
 
 
471 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  35.08 
 
 
444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  33.33 
 
 
460 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.62 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  34.22 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  35.32 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  33.41 
 
 
463 aa  282  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  37.39 
 
 
447 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  33.93 
 
 
447 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.66 
 
 
460 aa  279  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  33.41 
 
 
460 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  31.18 
 
 
460 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl217  Mg/Co/Ni transporter  35.15 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  31.96 
 
 
465 aa  272  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  34.96 
 
 
458 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  34.09 
 
 
463 aa  272  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  33.71 
 
 
447 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  33.65 
 
 
445 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  34.18 
 
 
450 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  39.1 
 
 
461 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  34.98 
 
 
449 aa  266  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  32.74 
 
 
458 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  34.66 
 
 
458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  31 
 
 
454 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  32.96 
 
 
461 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  33.33 
 
 
452 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  31.07 
 
 
454 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  32.43 
 
 
447 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  36.72 
 
 
451 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0009  magnesium transporter  33.4 
 
 
540 aa  253  5.000000000000001e-66  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.303937  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  31.69 
 
 
450 aa  253  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  32.39 
 
 
456 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.65 
 
 
451 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  32.23 
 
 
451 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  36.13 
 
 
454 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  34.02 
 
 
441 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  31.29 
 
 
461 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  31.29 
 
 
461 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  32.05 
 
 
454 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  32.48 
 
 
461 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  37.79 
 
 
351 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  33.79 
 
 
441 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  33.79 
 
 
441 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  31.42 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  31.42 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  31.11 
 
 
465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  31.11 
 
 
465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  30.35 
 
 
442 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  33.97 
 
 
456 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  31.79 
 
 
447 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  30.18 
 
 
456 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  30.18 
 
 
461 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  31.32 
 
 
457 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  31.75 
 
 
473 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  30.18 
 
 
456 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  31.98 
 
 
445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  30.22 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  31.74 
 
 
454 aa  232  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  30.7 
 
 
457 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33110  Mg2+ transporter MgtE  34.25 
 
 
446 aa  229  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237395  normal  0.754036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>