More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1375 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1375  aspartate kinase  100 
 
 		 449 aa  910    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000974637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0528  aspartate kinase  63.17 
 
 		 454 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000180899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3293  aspartate kinase  60 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1540  aspartate kinase  59.15 
 
 		 452 aa  553  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3141  aspartate kinase  60.44 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000375152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0425  aspartate kinase  51.12 
 
 		 452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0783  aspartate kinase  51.1 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.016394  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0339  aspartate kinase  47.54 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.893202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1388  aspartate kinase  47.53 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0011812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1415  aspartate kinase  47.53 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000337158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0896  aspartate kinase  48.43 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0170184  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1544  aspartate kinase  44.22 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0611  aspartate kinase  40.58 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0132396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1078  aspartate kinase  41.46 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0935045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0784  aspartate kinase  41.19 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2352  aspartate kinase  44.52 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16060  aspartate kinase  37.03 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  hitchhiker  0.000000275523 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0541  aspartate kinase  36.3 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116539  hitchhiker  0.00000501097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  32.84 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  33.48 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  32.33 
 
 		 465 aa  206  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  29.96 
 
 		 819 aa  190  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  32.2 
 
 		 463 aa  190  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.21 
 
 		 819 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  31.85 
 
 		 462 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.77 
 
 		 819 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.66 
 
 		 819 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.66 
 
 		 819 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.66 
 
 		 819 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.85 
 
 		 820 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  32.18 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.85 
 
 		 820 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.85 
 
 		 820 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.66 
 
 		 820 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.85 
 
 		 820 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.96 
 
 		 818 aa  186  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  29.42 
 
 		 820 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.42 
 
 		 820 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.42 
 
 		 820 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.64 
 
 		 820 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.42 
 
 		 820 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.42 
 
 		 820 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  29.42 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  29.42 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.06 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.42 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.85 
 
 		 820 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.68 
 
 		 818 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.25 
 
 		 818 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.45 
 
 		 819 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.45 
 
 		 819 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.45 
 
 		 819 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  32.03 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  30.7 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.43 
 
 		 822 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.19 
 
 		 814 aa  173  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.15 
 
 		 822 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.43 
 
 		 822 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.15 
 
 		 822 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.96 
 
 		 822 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.06 
 
 		 815 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.07 
 
 		 822 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.09 
 
 		 821 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.91 
 
 		 815 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.97 
 
 		 819 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.07 
 
 		 822 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  28.57 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.07 
 
 		 822 aa  170  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.87 
 
 		 822 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  29.3 
 
 		 471 aa  169  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  29.87 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.37 
 
 		 835 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  27.56 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.27 
 
 		 823 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.85 
 
 		 819 aa  167  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  27.66 
 
 		 469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.17 
 
 		 825 aa  166  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  29.17 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.98 
 
 		 819 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  30.19 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  28.63 
 
 		 823 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  29.2 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  29.03 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  28.27 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.1 
 
 		 835 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.36 
 
 		 804 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.89 
 
 		 822 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1214  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.5 
 
 		 816 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  25.99 
 
 		 818 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.46 
 
 		 817 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  26.45 
 
 		 821 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  28.75 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  30.17 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  27.31 
 
 		 834 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  28.12 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.42 
 
 		 821 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  27.87 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  28.24 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  27.2 
 
 		 468 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  25.78 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>