211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0860 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  65.99 
 
 		 196 aa  250  9.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  63.64 
 
 		 195 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  63.13 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  60.1 
 
 		 191 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  59.09 
 
 		 191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  56.35 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  58.59 
 
 		 191 aa  228  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  57.58 
 
 		 191 aa  228  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  57.36 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  55.05 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  55.61 
 
 		 190 aa  225  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  55.56 
 
 		 191 aa  224  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  57.14 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  55.56 
 
 		 190 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  55.05 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  56.57 
 
 		 196 aa  221  7e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  55.9 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  59.79 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  55.05 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  58.46 
 
 		 188 aa  217  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  53.03 
 
 		 191 aa  217  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  59.9 
 
 		 178 aa  217  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  54.31 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  56.92 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  53.81 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  52.02 
 
 		 191 aa  215  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  56.12 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  52.02 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  54.08 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  53.89 
 
 		 194 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  52.6 
 
 		 178 aa  207  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  53.89 
 
 		 194 aa  207  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  53.81 
 
 		 178 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  52.85 
 
 		 190 aa  205  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  52.79 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  52.79 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  60 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  53.3 
 
 		 179 aa  204  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  52.33 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  51.79 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  51.79 
 
 		 179 aa  201  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  50 
 
 		 191 aa  200  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  51.27 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  48.7 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  53.09 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  51.28 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  47 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  48.96 
 
 		 194 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  52.31 
 
 		 177 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  48.45 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  50 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  49.48 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  48.45 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  45.08 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  48.7 
 
 		 696 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  47.67 
 
 		 696 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  45.31 
 
 		 392 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  43.23 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  40 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  40 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  42.93 
 
 		 215 aa  151  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  42.11 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  42.11 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  42.11 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  39.9 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  41.58 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  41.88 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  44.59 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  37.23 
 
 		 172 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  41.22 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  43.24 
 
 		 140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  42.57 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  42.57 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  36.81 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  42.57 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  36.22 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  40.54 
 
 		 140 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  43.71 
 
 		 144 aa  107  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  42.76 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.67 
 
 		 140 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  44.59 
 
 		 146 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  40.13 
 
 		 144 aa  106  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  44.68 
 
 		 139 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  44.76 
 
 		 140 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  44.76 
 
 		 146 aa  104  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  39.86 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  41.96 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  39.86 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  39.86 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  44.06 
 
 		 140 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  40.69 
 
 		 139 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  41.89 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>