More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2389 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  44.1 
 
 
198 aa  148  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.13 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  39.32 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  38.3 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  41.05 
 
 
193 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  42.23 
 
 
202 aa  125  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  37.82 
 
 
195 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  35.81 
 
 
235 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  37.44 
 
 
235 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.41 
 
 
231 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  37.25 
 
 
202 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  34.85 
 
 
200 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00023  39.61 
 
 
214 aa  121  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201169  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  37.33 
 
 
235 aa  121  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.39 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  38.07 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0417  hypothetical protein  38.61 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  34.36 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  39.47 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  36.68 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  37.75 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.47 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  36.92 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.06 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  37.17 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.47 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.42 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  35.44 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.62 
 
 
198 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.38 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  35.27 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  34.95 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.62 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.62 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.1 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.1 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.1 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  36.76 
 
 
214 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.57 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  33.67 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  34.72 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.34 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  33.67 
 
 
198 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  33.5 
 
 
198 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  37.25 
 
 
217 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  37.31 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  32.7 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1338  protein of unknown function DUF205  34.43 
 
 
222 aa  107  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.265905  normal  0.438388 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf866  hypothetical protein  36.32 
 
 
220 aa  107  1e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  34.5 
 
 
200 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  33 
 
 
198 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  39.67 
 
 
194 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  34.2 
 
 
196 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  33.65 
 
 
210 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  37.56 
 
 
207 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  42.71 
 
 
190 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  42.71 
 
 
190 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  35.03 
 
 
203 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.5 
 
 
207 aa  105  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  37.44 
 
 
195 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1023  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.39 
 
 
219 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0416412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  38.66 
 
 
201 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.38 
 
 
198 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  38.31 
 
 
202 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  35.15 
 
 
214 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.5 
 
 
194 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  33.85 
 
 
222 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2815  protein of unknown function DUF205  38.21 
 
 
205 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.96 
 
 
215 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0632  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.31 
 
 
213 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  36.23 
 
 
209 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  33.16 
 
 
198 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  35.71 
 
 
191 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.54 
 
 
208 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  35.64 
 
 
195 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  32.09 
 
 
220 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  35.47 
 
 
208 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.15 
 
 
198 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  32.34 
 
 
215 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.53 
 
 
196 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.88 
 
 
199 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.59 
 
 
216 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  35.38 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6612  protein of unknown function DUF205  35.15 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0697451 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  37.5 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  35.12 
 
 
198 aa  99  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  38.02 
 
 
196 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  32.68 
 
 
201 aa  99  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  36.82 
 
 
202 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  36.82 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  98.2  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  33.8 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  33.49 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3740  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.16 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  33.85 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2760  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.86 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4326  membrane protein  35.08 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  34.17 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>