23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1416 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  100 
 
 
578 aa  1197  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  27.88 
 
 
606 aa  149  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  27.1 
 
 
527 aa  130  8e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.33 
 
 
579 aa  115  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  26.22 
 
 
551 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  25.37 
 
 
563 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  25.37 
 
 
563 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  26.07 
 
 
549 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  24.63 
 
 
550 aa  95.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  24.46 
 
 
559 aa  93.6  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  4.38453e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  25.34 
 
 
555 aa  92.8  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  23.89 
 
 
568 aa  85.5  3e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  24.86 
 
 
574 aa  80.9  6e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  26.72 
 
 
551 aa  70.1  1e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  26.55 
 
 
324 aa  65.1  4e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  24.04 
 
 
554 aa  63.2  1e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  21.86 
 
 
541 aa  53.9  9e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  21.8 
 
 
613 aa  50.8  7e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  30.95 
 
 
1132 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.52182e-06  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  22.45 
 
 
588 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.03 
 
 
607 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  25.5 
 
 
197 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  25.5 
 
 
197 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>