23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1416 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  100 
 
 		 578 aa  1197    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  27.88 
 
 		 606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  27.1 
 
 		 527 aa  130  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.33 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  26.22 
 
 		 551 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  25.37 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  25.37 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  26.07 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  24.63 
 
 		 550 aa  95.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  24.46 
 
 		 559 aa  93.6  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  25.34 
 
 		 555 aa  92.8  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  23.89 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  24.86 
 
 		 574 aa  80.9  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  26.72 
 
 		 551 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  26.55 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  24.04 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  21.86 
 
 		 541 aa  53.9  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  21.8 
 
 		 613 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  30.95 
 
 		 1132 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  22.45 
 
 		 588 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.03 
 
 		 607 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  25.5 
 
 		 197 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  25.5 
 
 		 197 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>