35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0703 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
331 aa  674    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  74.62 
 
 
331 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  71.3 
 
 
331 aa  517  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  67.37 
 
 
331 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  64.95 
 
 
331 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  61.63 
 
 
331 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  63.03 
 
 
332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  53.01 
 
 
333 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  54.75 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  52.08 
 
 
330 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  50.3 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  49.54 
 
 
335 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  51.63 
 
 
337 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  48.48 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  47.35 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  47.62 
 
 
342 aa  305  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  46.3 
 
 
339 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.21 
 
 
233 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.99 
 
 
255 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  33.33 
 
 
249 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  30.55 
 
 
248 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  32.21 
 
 
244 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  27.59 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  27.17 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  25.48 
 
 
255 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25.1 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  27.55 
 
 
262 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  26.52 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  22.69 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  22.33 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  25.19 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  24 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  23.41 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  21.51 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.49 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>