22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0067 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  100 
 
 		 92 aa  184  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  87.91 
 
 		 92 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  71.05 
 
 		 77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  63.93 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  41.33 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  45.33 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.67 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  48.48 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  54.76 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  79.31 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  45.45 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.71 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  40.28 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  35.53 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  65.52 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  51.35 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  36.84 
 
 		 82 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  36.36 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  58.06 
 
 		 86 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>