38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0180 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  100 
 
 
209 aa  423  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  44.5 
 
 
207 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  43.54 
 
 
207 aa  172  3e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  32.86 
 
 
202 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.57 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.44 
 
 
207 aa  89  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  32.32 
 
 
195 aa  68.9  5e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2792  hypothetical protein  27.23 
 
 
207 aa  66.2  3e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  27.75 
 
 
200 aa  64.3  1e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  25 
 
 
196 aa  58.9  5e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  28.57 
 
 
204 aa  58.2  8e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  27.5 
 
 
201 aa  55.5  5e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.21511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  23.98 
 
 
196 aa  53.5  2e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.57 
 
 
200 aa  53.5  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.91679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.41 
 
 
196 aa  53.1  3e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.37 
 
 
196 aa  53.1  3e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  28.42 
 
 
196 aa  52.8  4e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  23.96 
 
 
195 aa  52.4  5e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.06 
 
 
205 aa  52.4  5e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.11 
 
 
197 aa  52  6e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.11 
 
 
201 aa  51.6  7e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.11 
 
 
201 aa  51.6  7e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  27.4 
 
 
201 aa  52  7e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.11 
 
 
201 aa  51.6  7e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.62 
 
 
201 aa  51.2  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  28.71 
 
 
199 aa  50.1  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  25.62 
 
 
201 aa  48.9  6e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.06943e-07  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  25.62 
 
 
201 aa  48.9  6e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  25.62 
 
 
201 aa  48.9  6e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.38757e-05  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.62 
 
 
201 aa  48.5  7e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  25.62 
 
 
197 aa  48.5  8e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.67 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.12 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  25.12 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  24.14 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.27 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  27.88 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.88 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>