72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3464 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  100 
 
 		 262 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  43.87 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  41.43 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  41.43 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  41.43 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  41.43 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  45.79 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  39.44 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  39.44 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.607229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  39.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  39.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  39.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  39.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  39.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  39.04 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  39.04 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  40.61 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  35.86 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  38.46 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.25 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  32.69 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  40.8 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  40.47 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  40.55 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  42.58 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  32.21 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  32.21 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  37.3 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.58 
 
 		 218 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  29.44 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.71 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  29.75 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  36.19 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.58 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  37.9 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.32 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  33.9 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.35 
 
 		 218 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.66 
 
 		 217 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  29.95 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  35.68 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  30.19 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  25.59 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  30.56 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.78 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  35.11 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  40.76 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  31.28 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  23.21 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.23 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  26.38 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  29.05 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  37.32 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  33.17 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.69 
 
 		 222 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  23.89 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  23.89 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  30.67 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  33.33 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  29.71 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  29.38 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  28 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  36.53 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  26.32 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.23 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.37 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  32.06 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  29.44 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  26.42 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0674  3-dehydroquinate dehydratase, putative  25.89 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10544  pentafunctional AROM polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06460)  26.29 
 
 		 688 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.572044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>