More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00930 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00930  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.61 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2628  hydrogenase-4 component A  48.42 
 
 
205 aa  177  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.493395  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.42 
 
 
205 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.68 
 
 
205 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2853  hydrogenase-4 component A  48.65 
 
 
205 aa  175  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2613  hydrogenase-4 component A  48.68 
 
 
205 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3703  hydrogenase-4 component A  47.37 
 
 
205 aa  175  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2763  iron-sulfur cluster-binding protein  48.68 
 
 
205 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02373  hydrogenase 4, 4Fe-4S subunit  48.68 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02335  hypothetical protein  48.68 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2858  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.07 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.874792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1286  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.92 
 
 
208 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.56 
 
 
208 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  48.94 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  48.94 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.4 
 
 
203 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  48.4 
 
 
203 aa  164  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  48.4 
 
 
203 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  48.4 
 
 
203 aa  164  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.4 
 
 
203 aa  164  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3004  formate hydrogenlyase subunit B  48.4 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3039  formate hydrogenlyase subunit B  48.4 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  48.4 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3152  formate hydrogenlyase, subunit B  47.87 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3162  formate hydrogenlyase, subunit B  48.4 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.263749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  48.4 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3012  formate hydrogenlyase, subunit B  47.87 
 
 
203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.4 
 
 
202 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.84 
 
 
204 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.55 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.62 
 
 
188 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.95 
 
 
176 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.23 
 
 
653 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.23 
 
 
653 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.83 
 
 
658 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.23 
 
 
653 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.23 
 
 
653 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.62 
 
 
153 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 
653 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 
659 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  37.77 
 
 
659 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  37.77 
 
 
659 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.57 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.79 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.04 
 
 
180 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  37.57 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.84 
 
 
671 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.37 
 
 
674 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.37 
 
 
674 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1792  electron transport protein HydN  32.31 
 
 
189 aa  109  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.288357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  37.56 
 
 
181 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 
671 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.7 
 
 
671 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.37 
 
 
185 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  37.37 
 
 
185 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  39.29 
 
 
157 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  37.95 
 
 
175 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 
157 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  37.04 
 
 
181 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  37.04 
 
 
181 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.69 
 
 
157 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  37.04 
 
 
181 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  37.04 
 
 
181 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  37.04 
 
 
181 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  38.95 
 
 
157 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.69 
 
 
157 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  38.95 
 
 
157 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  36.84 
 
 
185 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.22 
 
 
667 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.75 
 
 
189 aa  104  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  39.29 
 
 
157 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 
157 aa  104  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  39.29 
 
 
157 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 
157 aa  104  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  31.96 
 
 
639 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  31.96 
 
 
639 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  38.69 
 
 
157 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.96 
 
 
639 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  38.95 
 
 
157 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.96 
 
 
639 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.78 
 
 
162 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  39.78 
 
 
162 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  39.78 
 
 
162 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  39.78 
 
 
162 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
173 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.78 
 
 
162 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>