141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0024 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  57.79 
 
 
576 aa  640  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1499  formate--tetrahydrofolate ligase  64.16 
 
 
570 aa  735  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.441254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  57.97 
 
 
564 aa  649  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  57.93 
 
 
573 aa  642  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0024  Formate--tetrahydrofolate ligase  100 
 
 
572 aa  1147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  57.79 
 
 
576 aa  639  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  60.6 
 
 
564 aa  666  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  55.44 
 
 
567 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  56.04 
 
 
565 aa  614  1e-174  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  53.15 
 
 
566 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.88 
 
 
567 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  51.4 
 
 
567 aa  577  1e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.26752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  50.87 
 
 
555 aa  563  1e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  52.45 
 
 
564 aa  558  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  50.96 
 
 
555 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  50.87 
 
 
557 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  51.14 
 
 
559 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  49.48 
 
 
556 aa  541  1e-152  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  48.87 
 
 
558 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.96 
 
 
554 aa  536  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  49.56 
 
 
559 aa  535  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.08 
 
 
553 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  51.92 
 
 
555 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  51.92 
 
 
555 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  50.52 
 
 
558 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.17 
 
 
554 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  50.09 
 
 
559 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  48.09 
 
 
561 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  48.6 
 
 
556 aa  525  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
556 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  47.99 
 
 
556 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  48.78 
 
 
558 aa  522  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
556 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  49.48 
 
 
557 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  48.77 
 
 
555 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  49.65 
 
 
558 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  50.87 
 
 
557 aa  516  1e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2316  formate--tetrahydrofolate ligase  50.87 
 
 
557 aa  516  1e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  48.78 
 
 
559 aa  517  1e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1079  formate--tetrahydrofolate ligase  48.25 
 
 
552 aa  518  1e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000612809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  49.21 
 
 
557 aa  516  1e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  49.47 
 
 
555 aa  515  1e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.48 
 
 
557 aa  517  1e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.04 
 
 
557 aa  515  1e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.56 
 
 
557 aa  517  1e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  47.56 
 
 
556 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  49.04 
 
 
558 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.54 
 
 
553 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  47.47 
 
 
556 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  50.52 
 
 
557 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  48.08 
 
 
583 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1275  formate--tetrahydrofolate ligase  49.65 
 
 
560 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  49.13 
 
 
556 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  4.22387e-06 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1058  formate--tetrahydrofolate ligase  49.02 
 
 
542 aa  507  1e-142  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  47.13 
 
 
555 aa  506  1e-142  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0304  formate--tetrahydrofolate ligase  46.95 
 
 
551 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  47.54 
 
 
560 aa  504  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  48.52 
 
 
557 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1054  formate--tetrahydrofolate ligase  48.84 
 
 
542 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0556  formate--tetrahydrofolate ligase  48.73 
 
 
582 aa  501  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.124626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3083  formate--tetrahydrofolate ligase  49.21 
 
 
559 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  47.55 
 
 
557 aa  502  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  46.41 
 
 
556 aa  501  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
583 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  47.73 
 
 
562 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00590  folic acid and derivative metabolism-related protein, putative  45.74 
 
 
1021 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
562 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
562 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
562 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  47.39 
 
 
557 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  2.24598e-07 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
562 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
562 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  49.83 
 
 
559 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  47.9 
 
 
562 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2355  formate--tetrahydrofolate ligase  47.41 
 
 
569 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1383  formate--tetrahydrofolate ligase  50.8 
 
 
565 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  47.35 
 
 
564 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28303  predicted protein  45.09 
 
 
662 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00317513  decreased coverage  0.000285759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  47.55 
 
 
583 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.69 
 
 
555 aa  497  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  49.83 
 
 
555 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2358  formate--tetrahydrofolate ligase  48.7 
 
 
558 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269795  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  47.55 
 
 
562 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02250  Formate-tetrahydrofolate ligase  50.26 
 
 
555 aa  494  1e-138  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000208  formate--tetrahydrofolate ligase  46.19 
 
 
582 aa  494  1e-138  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0837  formate--tetrahydrofolate ligase  47.38 
 
 
556 aa  492  1e-138  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.21789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  48.61 
 
 
557 aa  493  1e-138  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_80013  mitochondrial C1- tetrahydrofolate synthase precursor  43.99 
 
 
995 aa  493  1e-138  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.959666  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88119  tetrahydrofolate synthase  43.96 
 
 
946 aa  495  1e-138  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.226712  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1787  formate--tetrahydrofolate ligase  46.49 
 
 
555 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1822  formate--tetrahydrofolate ligase  46.49 
 
 
555 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.38 
 
 
551 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05943  formate--tetrahydrofolate ligase  46.02 
 
 
582 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  45.79 
 
 
555 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1055  formate--tetrahydrofolate ligase  46.15 
 
 
556 aa  491  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  46.34 
 
 
570 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0269  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.37 
 
 
551 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49229  fomate-tetrahydrofolate ligase  45.79 
 
 
666 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167975  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0671  formate--tetrahydrofolate ligase  46.14 
 
 
597 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4339  formate--tetrahydrofolate ligase  45.98 
 
 
570 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>