23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8940 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  100 
 
 		 519 aa  1042    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  60.27 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  36.9 
 
 		 500 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  36.18 
 
 		 500 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  31.98 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  31.94 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  29.77 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  31.29 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  29.1 
 
 		 487 aa  153  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  27.86 
 
 		 521 aa  136  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  25.49 
 
 		 501 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  29.4 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  26.19 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4558  narrowly conserved hypothetical protein  28.89 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167516 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4503  hypothetical protein  28.14 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  28.6 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  24.28 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8297  hypothetical protein  24.57 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1571  hypothetical protein  27.95 
 
 		 502 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321873  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0369  hypothetical protein  27.09 
 
 		 495 aa  91.3  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  25.55 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4944  hypothetical protein  25.1 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3323  hypothetical protein  24.17 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34323  normal  0.797481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>