More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1863 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 332 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  57.37 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  57.28 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  54.58 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  54.52 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  49.36 
 
 		 341 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  49.03 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  47.16 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  50.33 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  50.33 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  45.82 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  46.13 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  45.98 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  46.58 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  46.38 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  46.05 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  45.45 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  48.67 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  48.67 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  44.19 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  45 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  47.52 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  45.07 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  44.16 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  45.33 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  44.97 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  43.83 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  45.05 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  42.49 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.73 
 
 		 353 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.73 
 
 		 353 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.73 
 
 		 353 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  45.03 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  43.93 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  44.3 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  43.93 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  43.51 
 
 		 308 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  43.61 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  44.63 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  42.44 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 		 360 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  43.61 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  43.89 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  43.18 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  41.31 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  44.34 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  42.24 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.89 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  45.33 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  46.86 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  47.33 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  46.28 
 
 		 324 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  40.92 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  40.92 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  39.8 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 312 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  46.51 
 
 		 324 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  42.26 
 
 		 322 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  40.52 
 
 		 312 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.22 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  38.22 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  38.22 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.22 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  40.72 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  37.9 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  42.62 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.82 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  41 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  39.87 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  39.87 
 
 		 319 aa  255  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  40.52 
 
 		 312 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  40 
 
 		 308 aa  255  9e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  45 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  41.04 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  44.12 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  42.04 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  44.12 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  39.03 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>