More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1431 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 
386 aa  793  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  74.54 
 
 
384 aa  607  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.06 
 
 
386 aa  596  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.7 
 
 
385 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  70.91 
 
 
386 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  67.1 
 
 
386 aa  540  1e-152  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.05 
 
 
386 aa  538  1e-152  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.9 
 
 
390 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.44 
 
 
387 aa  471  1e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.4 
 
 
387 aa  465  1e-130  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.33 
 
 
388 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.07 
 
 
388 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.88 
 
 
387 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.2 
 
 
385 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.32 
 
 
385 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.78 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  3.70848e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.69 
 
 
395 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
390 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 
390 aa  326  4e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.85 
 
 
384 aa  322  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  48.01 
 
 
387 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.88 
 
 
398 aa  313  5e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 
399 aa  305  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 
400 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.89 
 
 
400 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.89 
 
 
400 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
392 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.37 
 
 
400 aa  291  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 
400 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
400 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 
395 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.57 
 
 
400 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.81233e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.31 
 
 
400 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.37 
 
 
400 aa  286  3e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
383 aa  275  1e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
383 aa  275  1e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
383 aa  275  1e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  39.27 
 
 
383 aa  275  1e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
383 aa  275  1e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
383 aa  275  1e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
383 aa  275  1e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
383 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
383 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
383 aa  273  5e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
383 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
382 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
382 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
382 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.8 
 
 
402 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
383 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  37.4 
 
 
381 aa  258  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
382 aa  258  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 
382 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
382 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
383 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
382 aa  256  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
383 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
382 aa  254  1e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  39.52 
 
 
388 aa  254  1e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
382 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
382 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
382 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.5 
 
 
382 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.81 
 
 
382 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
383 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 
382 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
382 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  37.43 
 
 
382 aa  249  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
382 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 
388 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
382 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.55 
 
 
382 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
382 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
382 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
382 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
385 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
383 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
393 aa  246  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
387 aa  245  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
387 aa  244  1e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
382 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.89 
 
 
393 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 
384 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
387 aa  242  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.72566e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
887 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
387 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
383 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.44 
 
 
872 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
383 aa  240  3e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
389 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
383 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 
381 aa  237  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  36.55 
 
 
385 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  36.13 
 
 
382 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  36.65 
 
 
382 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
393 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  36.55 
 
 
385 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  36.65 
 
 
382 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>