62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0692 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  58.28 
 
 
718 aa  884    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  58.83 
 
 
718 aa  890    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  59.33 
 
 
718 aa  895    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  58.28 
 
 
718 aa  888    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  61.21 
 
 
718 aa  937    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  44.2 
 
 
734 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  60.8 
 
 
718 aa  907    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  58.97 
 
 
718 aa  894    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  61.7 
 
 
738 aa  918    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  58 
 
 
718 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  58.97 
 
 
718 aa  893    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  60.94 
 
 
718 aa  912    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  59.89 
 
 
718 aa  900    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  58.28 
 
 
718 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  58.86 
 
 
718 aa  890    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  100 
 
 
731 aa  1521    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  57.94 
 
 
718 aa  884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  51.38 
 
 
721 aa  761    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  45.99 
 
 
707 aa  652    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  44.73 
 
 
731 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  58.64 
 
 
718 aa  894    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  45.64 
 
 
716 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  44.05 
 
 
743 aa  631  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  43.59 
 
 
729 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  43.13 
 
 
732 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  43.8 
 
 
732 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  43.8 
 
 
732 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  44.19 
 
 
716 aa  622  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  42.32 
 
 
739 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  42.99 
 
 
732 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  43.38 
 
 
732 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  43.53 
 
 
732 aa  621  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  43.4 
 
 
732 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  42.86 
 
 
732 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  43.86 
 
 
941 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  44.63 
 
 
720 aa  615  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  43.39 
 
 
740 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  42.86 
 
 
732 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  40.08 
 
 
732 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  41.42 
 
 
715 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  38.05 
 
 
767 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  35.71 
 
 
786 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  32.49 
 
 
725 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  33.83 
 
 
714 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  34.39 
 
 
721 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  33.06 
 
 
714 aa  363  6e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  31.36 
 
 
704 aa  359  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  33.24 
 
 
722 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  32.64 
 
 
712 aa  335  3e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  32.22 
 
 
720 aa  327  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  29.25 
 
 
713 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  37.36 
 
 
718 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  28.59 
 
 
688 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  27.89 
 
 
706 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  27.37 
 
 
701 aa  223  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  27.96 
 
 
714 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.6 
 
 
706 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.46 
 
 
706 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  27.6 
 
 
710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  27.33 
 
 
751 aa  191  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  26.68 
 
 
711 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  23.29 
 
 
759 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>