More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0433 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  99.33 
 
 
445 aa  876    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  100 
 
 
445 aa  881    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  51.41 
 
 
440 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  46.14 
 
 
434 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  47.33 
 
 
429 aa  353  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  42.69 
 
 
433 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  38.36 
 
 
444 aa  311  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  37.35 
 
 
445 aa  295  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  37.2 
 
 
443 aa  294  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
441 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
431 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  37.2 
 
 
431 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  32.46 
 
 
444 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
446 aa  275  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  33.65 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  32.93 
 
 
465 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  34.23 
 
 
447 aa  268  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  33.74 
 
 
442 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0561  protein of unknown function DUF21  35.66 
 
 
498 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.81 
 
 
445 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  33.25 
 
 
479 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  33.73 
 
 
443 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  33.25 
 
 
451 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  33.25 
 
 
451 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  33.25 
 
 
451 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  35.2 
 
 
434 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  33.25 
 
 
443 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.29 
 
 
447 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  33.67 
 
 
555 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  33.96 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  31.28 
 
 
436 aa  259  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  33.02 
 
 
451 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  33.02 
 
 
533 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  31.28 
 
 
432 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  33.33 
 
 
443 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
444 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  32.86 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  33.65 
 
 
433 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  30.22 
 
 
438 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  33.89 
 
 
439 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32 
 
 
440 aa  249  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  33.41 
 
 
436 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  34.71 
 
 
414 aa  248  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.01 
 
 
446 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  32.71 
 
 
432 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  32.48 
 
 
456 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
430 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  32.47 
 
 
432 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  29.58 
 
 
433 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  33.16 
 
 
439 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  32.08 
 
 
440 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  32.47 
 
 
432 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  32.24 
 
 
432 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  31.59 
 
 
434 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.31 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.31 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  32.31 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.79 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  32.08 
 
 
440 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  32.47 
 
 
441 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 
442 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.78 
 
 
435 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  32.08 
 
 
442 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  30.27 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  30.27 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.84 
 
 
442 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  31.62 
 
 
442 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  31.76 
 
 
432 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
435 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.99 
 
 
437 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  34.22 
 
 
428 aa  242  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  32.55 
 
 
435 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  32.31 
 
 
435 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  32.31 
 
 
435 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  32.31 
 
 
435 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  32.86 
 
 
424 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  32.31 
 
 
435 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 
417 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.24 
 
 
432 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.81 
 
 
420 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  32.04 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  31.28 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 
435 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 
435 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  29.62 
 
 
431 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  32.54 
 
 
424 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  34.66 
 
 
443 aa  239  5.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  33.17 
 
 
443 aa  239  5.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  32.3 
 
 
424 aa  239  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  33.25 
 
 
437 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  36.19 
 
 
421 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.99 
 
 
425 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  31.54 
 
 
487 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  31.07 
 
 
437 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  28.48 
 
 
460 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  30.34 
 
 
439 aa  237  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 
448 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>