More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1849 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  50.53 
 
 
291 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  49.47 
 
 
292 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  46.69 
 
 
284 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  48.19 
 
 
318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 
294 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  41.57 
 
 
348 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  45.02 
 
 
352 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  46.25 
 
 
443 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  42.68 
 
 
390 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  43.98 
 
 
451 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  43.7 
 
 
320 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 
283 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
281 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  41.73 
 
 
461 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  41.13 
 
 
461 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  40.94 
 
 
461 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  41.34 
 
 
461 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  41.34 
 
 
461 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 
406 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  40.24 
 
 
300 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 
421 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
453 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 
367 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 
386 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  32.89 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  36.48 
 
 
502 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  35.83 
 
 
454 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  33.74 
 
 
291 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  35.25 
 
 
795 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.22 
 
 
795 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.98 
 
 
796 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  33.99 
 
 
300 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
363 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  33.6 
 
 
300 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  33.73 
 
 
257 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
374 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 
300 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
300 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
300 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
300 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 
300 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
300 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  32.94 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
300 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  32.94 
 
 
300 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.42 
 
 
778 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  31.69 
 
 
423 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.34 
 
 
808 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.21 
 
 
750 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.2 
 
 
761 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  32.68 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.17 
 
 
770 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.23 
 
 
791 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.54 
 
 
789 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.94 
 
 
840 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.82 
 
 
752 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  33.21 
 
 
331 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.7 
 
 
868 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 
783 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.15 
 
 
679 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 
814 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.72 
 
 
786 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  33.86 
 
 
746 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 
479 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.23 
 
 
654 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.23 
 
 
773 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.23 
 
 
780 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.02 
 
 
818 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  33.85 
 
 
773 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
745 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.23 
 
 
772 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.23 
 
 
772 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 
477 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.51 
 
 
766 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.35 
 
 
771 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.99 
 
 
773 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.19 
 
 
773 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.68 
 
 
773 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.85 
 
 
757 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.8 
 
 
759 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.53 
 
 
798 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.92 
 
 
773 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.59 
 
 
839 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.97 
 
 
840 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.1 
 
 
773 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.64 
 
 
682 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.02 
 
 
775 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.82 
 
 
835 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.76 
 
 
809 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 
822 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2593  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
767 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180843  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  28.12 
 
 
825 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.86 
 
 
797 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.55 
 
 
811 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1270  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
767 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.791158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2686  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.46 
 
 
767 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 
800 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>