19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0603 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0463  hypothetical protein  45.74 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000202427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12360  LICD family protein  29.49 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0296  hypothetical protein  27.75 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.840944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 523 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  27.75 
 
 		 373 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  44.83 
 
 		 319 aa  52  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3213  hypothetical protein  29.01 
 
 		 651 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  51.35 
 
 		 384 aa  49.3  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2618  hypothetical protein  26.59 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1495  LicD family protein  25 
 
 		 454 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  56.76 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  35.29 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  44.23 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5030  hypothetical protein  27.96 
 
 		 424 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1175  LicD family protein  24.38 
 
 		 516 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  48.98 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  47.83 
 
 		 270 aa  42  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  60.61 
 
 		 277 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>