25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3238 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  792    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  43.81 
 
 
392 aa  316  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  41.65 
 
 
394 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  43.98 
 
 
400 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  38.95 
 
 
385 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  38.6 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  39.07 
 
 
390 aa  245  8e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  33.6 
 
 
383 aa  225  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  36.57 
 
 
376 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  35.43 
 
 
402 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  32.5 
 
 
386 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  34.88 
 
 
390 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  31.05 
 
 
375 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  24.93 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  25.46 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  27.27 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  22.55 
 
 
344 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  27.71 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  27.36 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1492  hypothetical protein  22.78 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.914795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  24.24 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  31.41 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0261  hypothetical protein  20.47 
 
 
338 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  26.59 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0288  hypothetical protein  24.75 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>