More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1437 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.11 
 
 
239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.58 
 
 
245 aa  304  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  48.97 
 
 
244 aa  232  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  44.07 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  43.88 
 
 
242 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  44.35 
 
 
263 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  42.68 
 
 
241 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  43.93 
 
 
240 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  43.93 
 
 
240 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  44.35 
 
 
240 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  43.93 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  43.88 
 
 
266 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  46.03 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  42.17 
 
 
247 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.4 
 
 
246 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.1 
 
 
240 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.62 
 
 
248 aa  198  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  41.42 
 
 
241 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.2 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.22 
 
 
259 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  41.84 
 
 
240 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3065  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.46 
 
 
247 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  42.68 
 
 
240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.26 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.67 
 
 
256 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.68 
 
 
240 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  42.68 
 
 
240 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.28 
 
 
270 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.42 
 
 
241 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  40.59 
 
 
241 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  43.46 
 
 
243 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.53 
 
 
239 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.26 
 
 
240 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  41.42 
 
 
240 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.6 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  40.08 
 
 
268 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.22 
 
 
256 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.83 
 
 
247 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  39.08 
 
 
289 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.83 
 
 
247 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  39.75 
 
 
263 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  38.91 
 
 
268 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  38.91 
 
 
268 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  38.91 
 
 
268 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  38.91 
 
 
268 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.18 
 
 
239 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.18 
 
 
239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  38.49 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  39.57 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  40.34 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  40.34 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  39.92 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3173  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.46 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  40.34 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.08 
 
 
240 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2975  hypothetical protein  40.48 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.43 
 
 
247 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  40.34 
 
 
239 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  36.86 
 
 
241 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1176  putative oxidoreductase  41.63 
 
 
247 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199647  normal  0.198576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2425  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.66 
 
 
244 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00338747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  40 
 
 
250 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.1 
 
 
257 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1171  oxidoreductase, putative  40.56 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.17 
 
 
239 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.92 
 
 
249 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  39.58 
 
 
246 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  40.33 
 
 
248 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  37.92 
 
 
242 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  38.33 
 
 
242 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  42.19 
 
 
260 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  39.15 
 
 
249 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5817  hypothetical protein  40.82 
 
 
247 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537036  normal  0.103138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.02 
 
 
246 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  39 
 
 
251 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39 
 
 
251 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  39 
 
 
251 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  37.92 
 
 
242 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  37.92 
 
 
242 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.85 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  41.35 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2930  hypothetical protein  41.87 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.656633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3932  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.4 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2001  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.92 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000985814  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  38.17 
 
 
256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.66 
 
 
265 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  41.6 
 
 
243 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.29 
 
 
239 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>