More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0153 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  100 
 
 		 330 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.62 
 
 		 325 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.79 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.07 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.39 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.69 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  55.27 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.45 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  55.88 
 
 		 333 aa  358  9e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.06 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  55.88 
 
 		 334 aa  355  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  53.67 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  55.31 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.67 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.94 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  51.13 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 		 329 aa  341  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.62 
 
 		 329 aa  340  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.38 
 
 		 332 aa  338  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  52.94 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.59 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.43 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  52.79 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  50.94 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  50.81 
 
 		 339 aa  332  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  52.29 
 
 		 332 aa  332  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  48.85 
 
 		 347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.62 
 
 		 332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  50.61 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  49.85 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 329 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  49.67 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  51.49 
 
 		 318 aa  325  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  51.31 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  49.84 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  49.84 
 
 		 331 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  45.82 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  51.14 
 
 		 318 aa  322  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  47.17 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  50.65 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  49.19 
 
 		 344 aa  322  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  50.33 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  50.33 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  50.33 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  50.98 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.01 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  50.98 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  50.98 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50.83 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 		 325 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  48.54 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.28 
 
 		 353 aa  318  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  49.67 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  48.84 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.08 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.41 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.88 
 
 		 344 aa  317  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  48.51 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  48.51 
 
 		 319 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  45.69 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  47.77 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 		 378 aa  315  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  47.48 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  44.48 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.34 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  47.87 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  49.35 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  44.66 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  47.85 
 
 		 319 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  47.85 
 
 		 319 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  44.17 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  47.85 
 
 		 319 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  47.85 
 
 		 319 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  45.71 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  48.54 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  47.38 
 
 		 335 aa  309  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  48.17 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  48.11 
 
 		 326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  45.89 
 
 		 323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.41 
 
 		 354 aa  308  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.3 
 
 		 356 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  47.3 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  46.56 
 
 		 370 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  46.89 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  48.84 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  46.53 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  48.17 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  46.47 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  48.04 
 
 		 345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  45.28 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  48 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  47.19 
 
 		 400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.28 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  44.13 
 
 		 390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  44.13 
 
 		 390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  44.13 
 
 		 390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  46.88 
 
 		 333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.58 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  45.42 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>