28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2536 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  68.81 
 
 
317 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  36.43 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  37.76 
 
 
357 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  38.84 
 
 
272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  40.93 
 
 
357 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  40.93 
 
 
357 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  40.93 
 
 
357 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  40.93 
 
 
357 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  40.93 
 
 
357 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  40.93 
 
 
357 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  40.93 
 
 
357 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  36.4 
 
 
316 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  33.56 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  37.56 
 
 
341 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  34.87 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  32.22 
 
 
356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  32.22 
 
 
366 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  31.53 
 
 
360 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  30.12 
 
 
315 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.38 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  32.22 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  32.5 
 
 
357 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  31.8 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  32.87 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  33.19 
 
 
347 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  32.39 
 
 
326 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3417  hypothetical protein  45 
 
 
457 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>