33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7366 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  100 
 
 
645 aa  1334    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  37.47 
 
 
713 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  35.34 
 
 
717 aa  220  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  33.77 
 
 
741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  34.28 
 
 
721 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  34.03 
 
 
714 aa  187  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  32.53 
 
 
724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  32.53 
 
 
724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  32.53 
 
 
724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  26.19 
 
 
624 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  26.19 
 
 
624 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  26.19 
 
 
624 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  26.19 
 
 
624 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  26.19 
 
 
624 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  26.19 
 
 
624 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  25.15 
 
 
714 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  26.11 
 
 
709 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  21.14 
 
 
616 aa  104  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  29.1 
 
 
693 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  22.96 
 
 
568 aa  88.2  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  24.68 
 
 
688 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  28.32 
 
 
572 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  23.53 
 
 
731 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  23.53 
 
 
731 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  26.8 
 
 
707 aa  73.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  21.74 
 
 
475 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.54 
 
 
617 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  21.05 
 
 
683 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  20.86 
 
 
683 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00539  hypothetical protein  32.56 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5045  hypothetical protein  22.25 
 
 
694 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0423827  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  57.14 
 
 
104 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  57.14 
 
 
104 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.642999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>